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来源：佰富彩计划2024-11-21 17:48

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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点：可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

重庆忠县：三峡橘乡田园综合体赋能乡村振兴******

　　中新网重庆1月11日电 (记者何蓬磊)记者从10日下午举行的忠县全面推进乡村振兴新闻发布会上获悉，自2020年底重庆市唯一一个国家级田园综合体——三峡橘乡田园综合体(以下简称：田园综合体)开园以来，目前运行情况良好，发挥着“国家级田园综合体佼佼者、乡村振兴示范园”的示范带动作用。

　　据悉，三峡橘乡田园综合体位于忠县新立镇，既是全国首批18个国家级田园综合体试点项目之一，也是三峡库区和重庆市唯一一个国家级田园综合体。项目重点依托柑橘种植业和加工业，打造乡村旅游目的地，推动一、二、三产业和农业、文化、旅游产业深度融合发展。

资料图为游客在三峡橘乡田园综合体的三峡柑橘文化时空馆参观。　何蓬磊摄

　　据忠县人民政府副县长田长忠介绍，田园综合体建成投运后，资金、人才、科技投入农业迎来黄金期。项目区100%的农户参与股权化改革，集体经济和群众收入大幅提升，农作物耕种收机械化率85%；智慧农业项目占全县的80%；电商数量和业务量均居全县第一，农产品商品化率达70%，农产品加工增值率全县第一，农民人均收入居全县第一，形成了高效、优质、安全、环保的农业体系。

　　“春闻橘香夏赏荷，秋收彩稻冬采橘……三峡橘乡田园综合体已成为热门打卡地。”田长忠介绍说，田园综合体休闲旅游人气集聚作用明显。去年以来，重庆多所高校以及中小学校将三峡橘乡田园综合体作为实践教学基地，累计接待学生8000余人次；2022年，累计接待各级考察团队200余起，接待社会游客70余万人次。

　　值得一提的是，以柑橘为重点的特色产业是忠县最大特色亮点。数据显示，忠县柑橘产业面积36万余亩，产量39万吨，实现综合产值40亿元以上，并建成“中国柑橘城”和国家级柑橘交易中心。

　　“目前，忠县基本建成三峡橘乡国家级田园综合体，正高水平打造三峡库心·长江盆景区域协同发展示范片，以独珠江村等48个美丽乡村建设为全域示范和具体抓手，加快推动宜居宜业和美丽乡村建设。”田长忠说。(完)

　　（文图：赵筱尘巫邓炎）

[责编：天天中]

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